Projekt FIT COW

Projekt FIT COW

Svaz chovatelů holštýnského skotu realizuje pro chovatele od roku 2018 plošnou genotypizaci jalovic pod názvem FIT cow. Tento projekt zahrnuje genotypování plemenic, které napomáhá k rychlejšímu získání genomických plemenných hodnot pro znaky zdraví a onemocnění paznehtů a podporuje vytvoření referenční populace krav, která v budoucnu doplní a nahradí referenční populaci založenou na býcích, aby byla zajištěna co nejvyšší spolehlivost genomických plemenných hodnot. Projekt FIT cow je vhodným nástrojem managementu stáda a optimalizace v oblasti selekce stáda. Chovatelům dává možnost získat genomické plemenné hodnoty svých plemenic za zvýhodněných podmínek.

Informace o projektu FIT cow ke stažení: pdf Fit cow info(198 KB)

fit cow

Programy a návody na genotypování zde

Výsledky projektu

Počet genotypovaných jalovic dosáhl v prosinci 2024 přes 94 tisíc, z toho více než 90 tis. má vypočítané genomické plemenné hodnoty (GPH). Výsledky jednoznačně ukazují, že genomické výpočty jsou následně potvrzené fenotypovými projevy a projekt na genoypování tak přináší chovatelům kýžené výsledky.

V následujících tabulkách jsou údaje o genomických plemenných hodnotách a následné užitkovosti genotypovaných zvířat z některých výpočtů.

Tabulky dávají přehled o tom, jak fenotypový projev (užitkovost, zevnějšek) potvrzuje plemenné hodnoty z genomiky.

sumář

výpočet říjen 2021

Mléčná užitkovost

Genomické PH pro mléko a následná užitkovost za celou laktaci jsou zobrazeny v následující tabulce. Jalovice byly rozděleny na základě GPH pro mléko získané z výpočtu před otelením do čtyř skupin po 25 %, čemuž odpovídá rozpětí GPH uvedené v prvním sloupci. V dalším sloupci je počet zvířat a následuje průměrná GPH za každou skupinu. Dále je uvedena PH, která vedle genotypu již byla vypočtena s údaji o dojivosti z kontrol užitkovosti za laktaci. Porovnáním průměrů GPH a PH s již zahrnutými fenotypy je zřejmé, že rozdíly jsou velmi malé. To znamená, že GPH za jednotlivé skupiny se shodují s PH, které již obsahují fenotypy (nádoje). V posledním sloupci je užitkovost za laktaci. Rozdíl mezi 25 % nejlepších a 25 % nejhorších tak dosahuje 1956 kg mléka (výpočet prosinec 2024). Z hodnocení byly vyloučeny prvotelky, které nesplnily parametry normální laktace podle metodiky KU.

tabulka RPH užitkovost

výpočet prosinec 2024

GPH užitkovost

Zevnějšek

Porovnání GEPH a fenotypu u všech znaků LPE a souhrnných charakteristik zevnějšku je v další tabulce. Jalovičky byly opět rozděleny podle jejich GPH před otelením na skupiny po 25 %. V prosinci 2022 z nich bylo oteleno a mělo ohodnocen zevnějšek více než 12 852. V tabulce jsou průměrné RPH z genomického výpočtu, PH s již zahrnutým hodnocením zevnějšku a v posledním sloupci je průměrné hodnocení bonitéry. Z tabulek je zřejmé, že GPH získané u jaloviček jsou potvrzeny jejich fenotypovým hodnocením bonitéry. Rozdíly mezi výpočty pouze na základě genotypu a výpočtem s již zahrnutým hodnocením zevnějšku jsou mezi skupinami velmi malé, podobně jako u mléka. Také u souhrnných známek za zevnějšek koresponduje fenotyp (hodnocení bonitéra) s GPH. Rozdíl v bodovém hodnocení mezi 25 % nejlepších a nejhorších v prosincovém výpočtu 2024 dosahoval 3,3 bodového hodnocení.

tabulka RPH zevnějšek

výpočet prosinec 2024

GPH exterirér

Genotypování

Webová aplikace iGenetika

Genotypování plemenic zajišťuje laboratoř ČMSCH a.s. Pro komunikaci s chovateli byla vyvinuta aplikace iGenetika, která slouží k elektronickému zadávání objednávek na laboratorní rozbory, předání dat k výpočtu GPH, ověřování původu, stanovení QTL znaků (genetické vady, zbarvení) apod.

Návod k iGenetice ke stažení zde: pdf Návod iGenetika(292 KB)

cloudna

ClouDNA: Modul pro třídění dat z iGenetiky

Pro třídění dat GPH daného chovu a porovnání s populací byl vyvinut nový modul ClouDNA, kde mohou chovatelé jednoduše třídit data, filtrovat a vyhodnocovat průměrné GPH vybrané skupiny jalovic (podle ročníku narození, podle otců aj.). Výhodou je možnost nastavení vlastních selekčních kritérií a chovného cíle, podle nichž se chovatel může rozhodovat o selekci zvířat.

Videonávod pro ClouDNA

pdf Manuál ClouDNA genomika(1.15 MB)

default ClouDNA genomika - program pro management vašeho genotypovaného stáda(114 KB)

pdf Manuál pro výpočet US genomických PH(739 KB)

Součástí projektu je také systematický sběr informací o zdraví zvířat, proto je požadováno evidování diagnóz onemocnění formou Deníku nemocí. Manuál pro práci s aplikací ke stažení zde: pdf Manuál Deník nemocí a léčení(12.26 MB)

Odběr vzorku DNA

Podmínkou pro správnou analýzu DNA je kvalitní vzorek DNA zvířete, věnujte tedy dostatečnou pozornost odběru vzorku DNA. Odběrové sety pro odběr chlupových cibulek jsou zdarma k dispozici v laboratoři iGenetiky ČMSCH a.s. - objednávky na Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., sady pro odběr ušních chrupavek jsou za poplatek k objednání na Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript..

Termíny pro příjem vzorků DNA do laboratoře a datum publikace v roce 2026:

Termín doručení Datum publikace

2.12.2025 13.1.2026

30.12.2025 10.2.2026

27.1.2026 10.3.2026

24.2.2026 8.4.2026

31.3.2026 12.5.2026

28.4.2026 9.6.2026

2.6.2026 14.7.2026

30.6.2026 11.8.2026

28.7.2026 8.9.2026

1.9.2026 13.10.2026