V souladu s celosvětovým vývojem bylo šlechtění zaměřeno na souhrnný genotyp, tj. zlepšování více znaků na základě souhrnného selekčního indexu na ekonomické bázi. Původní index z roku 2004 zahrnoval podíl 65 % znaků produkce, 10 % plodnosti, 25 % zevnějšku a upřednostňoval produkční ukazatele a odpovídal tehdejším ekonomickým zájmům většiny chovů. V roce 2006 byly zařazeny do indexu somatické buňky váhou 5 %, o které se snížila váha znaků produkce.
Na základě změn ekonomických podmínek výroby mléka a rostoucímu významu funkčních vlastností, které významně ovlivňují celkovou rentabilitu chovu dojnic, došlo v roce 2008 k významné úpravě vah jednotlivých ukazatelů ve prospěch funkčních vlastností. Váha znaků produkce se snížila na 49 % se zahrnutím složek mléka, 25 % tvoří znaky zevnějšku významné pro tzv. funkční typ krav, 12 % tvoří plodnost dcer, 7 % funkční dlouhověkost a 7 % zdraví vemene (somatické buňky).
V roce 2016 došlo ke zvýšení váhy plodnosti na 15 %, mírnému snížení váhy zevnějšku na 24 % a dlouhověkosti na 5 % se zachováním váhy znaků produkce na 49 %.
Souhrnný selekční index SIH je hlavním selekčním ukazatelem u býků i krav.
Od roku 2025 má selekční index SIH nové složení, do něhož byl nově zahrnut index zdraví.
